Er zijn ernstige zorgen over de waterkwaliteit rondom Bonaire. Uit het meest uitgebreide onderzoek tot nu toe, uitgevoerd door onder andere Wageningen Marine Research en Stinapa, blijkt dat de kustwateren kampen met zware chemische verontreiniging en te hoge concentraties aan voedingsstoffen.
De vervuiling komt voornamelijk vanaf het land. Afvalwater, erosie en weggespoeld regenwater belanden in zee. De te hoge voedingsstoffenniveaus leiden tot overmatige algengroei, wat het koraal verstikt. Dit, samen met de stijgende zeetemperaturen, heeft een ernstige impact op de veerkracht van de riffen. Daarnaast zijn er chemische stoffen gevonden die zich kunnen ophopen in de voedselketen, wat mogelijk risico’s met zich meebrengt voor de volksgezondheid.
Het Bonaire Nature Platform roept het Openbaar Lichaam Bonaire en de Nederlandse overheid op om direct actie te ondernemen. De organisatie eist een betere aanpak van het afvalwater, strengere handhaving van milieuregels en de sanering van vervuilde locaties, zoals het Bopec-terrein. Volgens de natuurorganisaties is schoner water niet alleen cruciaal voor het milieu, maar ook voor het toerisme en de visserij op het eiland.